Vào năm 2039 , con người phải đối mặt với đại dịch virus khủng khiếp mang tên Gastrea. Cùng lúc đó họ còn phải đối với thảm hoạ không gian chấn do tinh linh tạo ra . Vậy nên chính phủ nhật bản đã tạo ra một tổ chức bí mật mang tên Tái tạo nhân loạ...