Lors d'une mission Lucy, mage de la célèbre guilde Fairy Tail, se sens observé et le soir attiré par une mystérieuse boule lumineuse qui explosa lorsqu'elle fut touchée. Suite à ça Lucy avait disparue ne laissant derrière elle que ses clés. 1 an après le miracle tant espéré est là. Lucy est là accompagnée de la guilde indépendante, Crime Sorcière. Seulement celle-ci ne se souviens de rien. Au fil du temps, Fairy Tail remarque que Lucy a développé une nouvelle magie non sans danger. Une nouvelle magie, une mémoire perdue et de plus en plus de personnes à l'observer ; tout cela a-t-il un lien ?