Bezpośrednia kontynuacja poprzedniej części. Seth i Kira wyruszają aby odnaleźć Mark'a, przed Lucy ważne zadanie, poprowadzić całe powstanie. Wszystko utrudnia fakt, że ktoś ponownie zasiadł na tronie D.O.O.M. i kontynuuje plany tej organizacji.
Historia opowiada o Ailli i jej bracie. Pewnego dnia ich przyjaciel znika bez śladu więc ci postanawiają go odnaleźć, lecz podczas poszukiwań zostają wplątani w powstanie przeciwko wielkiej oragnizacji zwanej D.O.O.M. Czy uda im się odnaleźć przyjaciela i czy wywalczą należącą się im wolność?