50 años despues de que godzilla matara a battra y lo sellaran en el oceano,sale para enfrentar a keizer ghidorah"el devodador de mundos" ademas de buscar reconciliarse con los kaijus

Desde que era una cría, Godzilla tuvo que sobrevivir por su cuenta al ser sido abandonado por su padre por ser el más débil y frágil que su hermano Dagon, teniendo una infancia muy dura. Desterrado, sintiéndose solo en un mundo que lo deseaba muerto, sus miedos se transformaron en una ira de la cuál su poder dependía, castigando a cualquiera que se meta en su camino. Pero no estaba solo del todo, pues pronto se uniría a un pequeño grupo de Kaijus como él deseosos por tener un mundo libre de la tiranía de Gojira, padre de Godzilla. Con ellos buscaría cumplir un objetivo en mente para ser el más fuerte y respetado; el Kaiju entre Kaijus, el Rey de los Mounstruos.