Это история о любви двух молодых парней, чьи сердца сплелись в один прекрасный день. История имеет печальный конец, приготовьте платки и салфетки. - Все действия происходят в параллельной вселенной, где организации NERV как таковой не существует. Все члены оригинального Evangelion'a разбросаны по Японии в хаотичном порядке. Аянами Рей, Лэнгли Сорью Аска, Икари Синдзи, Нагиса Каору, Судзухара Тодзи, Аида Кэнсукэ, Хораки Хикари - обычные ученики одной из японских школ Токио-3. Почти весь персонал оригинального Evangelion'a учителя в школе детей, либо же имеют связь со сферой образования.