Después de que Player y Carmen hackearan la central de ACME, la jefa no le ha agradado lo que hizo la ladrona camersí, y ha jurado no solo en atrapar a Carmen sino a su hacker. Por otro lado, VILE ya se encuentra en su nuevo cuartel y la facultad no duda en hallar una forma para detener a Carmen y al final llegan a una conclusión muy similar a la de ACME. Mientras tanto el equipo rojo se encuentra algo agobiado debido a que han tenido mucho que hacer como detener a VILE o huir de ACME sin mencionar que Carmen está decida en buscar a su madre, pero todo eso se ve interrumpido cuando Player se da cuenta que lo están cazando, obligando a Carmen irse a Ontario para ayudarlo

Carmen Sandiego siempre ha querido saber quién era su familia y conocerla pero el deseo se cumplió demasiado pronto, resulta que su hacker y su mejor amigo, Player,es su hermano y que su padre está con vida. Carmen no sabe si ese acontecimiento es bueno o malo, pero no hay tiempo para procesar bien esa información ya que la continua guerra contra VILE sigue de pie. VILE cuenta con 4 nuevos agentes, 2 de ellos son unas novatas que se pondrán a prueba para intentar capturar a Carmen, ya que, ellas tienen son la clave del éxito, según VILE. ACME no se ha quedado atrás, ahora cuenta con su nuevo integrante Graham. La continuación de mi tercera temporada de Carmen Sandiego titulada: Carmen Sandiego: El Juego Empieza