Todo ocurre después de los eventos en Jurassic Word 2, el doctor Henry Wu mando a unos hombres para que le lleven el cuerpo y le pueda sacar el ADN que el quiera, pero en medio camino el Indoraptor se logra regenerar (si tiene esa avilidad, cuando Owen le dispara se ven como las balas salen del cuerpo de Indoraptor) escapa y mata a los hombres.

Mothra, una Guardiana, una Protectora y una Defensora de la tierra. Tiene una nueva misión importante y es... Ser la Madre adoptiva de un Huevo. Pero este pequeño hará de la vida de Mothra una experiencia única para ella y algo que ella va a disfrutar, aunque no lo admita. (Comunmente Mothra es la menor y parece hija de Godzilla, pero esto cambia en esta historia, Aquí Godzilla es como el hijo de Mothra)