Sono oramai passati mesi e mesi da quando Shinichi é sparito nel nulla a parte quando si fa vedere qualche mese. La piccola Ran aspetta ancora con ansia il suo ritorno senza sapere che lo ha accanto ogni giorno. Shinichi Kudo, oramai da mesi conosciuto come il bambino Conan Edogawa, vorrebbe tanto rivelare alla ragazza di cui é profondamente innamorato la sua vera identità e i suoi sentimenti. Ma, anche se l'organizzazione degli uomini in nero é stata fermata, un antidoto per farlo tornare adulto non é stato trovato e Conan ha paura che qualche membro degli uomini in nero sia ancora in giro.

È una giornata qualunque per Conan a Beika. Il trillo del telefono strozza il silenzio. Kogoro (Goro) si leva dalla sua postazione preferita circondato da lattine di birra e risponde. Per chi non lo ha mai visto o letto, ecco la trama: Shinichi Kudo è un liceale di 17 anni e, nonostante la giovane età, è un abilissimo investigatore. Un giorno, recatosi con l'amica Ran a un parco divertimenti, assiste a un omicidio e risolve il caso. Prima di tornare a casa assiste allo scambio di un'ingente somma di denaro tra due uomini; uno di loro è vestito completamente di nero e fa parte di una misteriosa organizzazione criminale, che Shinichi chiama semplicemente Organizzazione nera. Preso da ciò che sta accadendo davanti ai suoi occhi Shinichi non si accorge dell'arrivo alle sue spalle di un altro affiliato e finisce col venire scoperto e catturato; essendo un testimone scomodo i due uomini decidono di ucciderlo somministrandogli una sostanza chiamata APTX4869 e lo abbandonano privo di sensi. Il farmaco, tuttavia, ha un effetto ben diverso sul giovane: lo ringiovanisce di dieci anni. Shinichi si rifugia dal vicino di casa, il professor Agasa e, seguendo il consiglio di quest'ultimo, decide di nascondere la propria identità ai conoscenti, onde evitare la possibile scoperta da parte dell'organizzazione della sua reale sorte. Il professor Agasa suggerisce al ragazzo di trasferirsi a casa di Ran e di suo padre, Kogoro Mori, un detective di seconda categoria. Da questo momento in poi Conan risolverà tutti i casi che verranno affidati a Kogoro con tutte invenzioni del professor Agasa, ideatore anche di altri strumenti utili a Conan nel corso delle indagini. È in questo modo che continuerà a investigare alla ricerca della più piccola prova che lo riavvicini all'Organizzazione. In un secondo momento irromperà sulla scena Ai Haibara, ex-membro dell'Organizzazione e creatrice dell'APTX4869, fuggita dopo avere assunto tale sostanza. Tratto da Wikipedia*