Il y à cent ans le continent de Ninjago était protéger par sept ninjas et un samouraï. Mais suite à une tragédie les ninjas disparaissent. Il est dit que seul un survécu maudit de l'immortalité et veille encore sur la cité de Ninjago, la protégeant des forces du mal. Attendant le retour de ses compagnons tombé et de son amant disparut. Avec le temps les ninjas son devenu une légende et plus personnes ne croit en leur existence. Mais l'histoire n'est jamais vraiment fini car cent ans plus tard sept adolescents venant de différents horizons ce retrouve tous en consultation chez un psychologue pour la même raison. Laquelle ? Eh bien ces sept adolescents font des rêves ressemblant à des souvenirs, chaque rêve complétant ceux des autres. Et lors d'une visite au musé d'histoire de Ninjago City, un monstre attaque les visiteurs dont les adolescents et un garçon portant une tenue de ninja les sauves. Après cet événement le groupe d'amis se lance dans un travail acharné pour trouvé le secret derrière les rêves, qui est le mystérieux ninja et apaiser la tristesse d'un enfant laissé seul trop longtemps. Les ténèbres sentent le changement dans les forces du bien et sont près à repassé à l'action brisant de nouveau la paix dans le royaume de Ninjago.

Le silencieux, La princesse de Jade, Harumi veut se faire pardonner pour tout le mal qu'elle a fait, mais sera-t-elle y arriver ? Elle pourra compter sur ces nouveaux alliés pour essayer de s'intégrer et pour affronter la vérité sur sa famille et sur elle-même. Mais qui est cette fameuse Harumi ? Et du côté des Ninjas, que vont-ils leurs arrivés ?