Han transcurrido dos meses desde el Incidente Mágico en el Campamento Everfree, la paz y la armonía parecen haber regresado a las calles de Canterlot City, pero este ambiente de tranquilidad y calma llega rápidamente a su fin cuando Twilight Sparkle, una joven e inteligente estudiante de Canterlot High School, recibe una carta de aceptación que la invita a formar parte del Programa de Estudio Independiente del Instituto Everton, una institución educativa que goza de un enorme prestigio dentro y fuera de los Estados Unidos de América debido a que en sus aulas y laboratorios solo estudian e investigan los mejores alumnos y las mentes más brillantes del mundo. Acompañada por Cadance, la joven Directora de Crystal Prep Academy, la chica emprenderá un viaje al Instituto Everton sin saber que, en aquel lejano lugar, se reencontrará con Moon Dancer, una vieja amiga de su infancia y quien, junto con otra chica, se encuentra trabajando en un experimento biológico que involucra a un misterioso virus cuyos efectos parecen traer beneficios a la salud de los seres humanos, garantizando así un mundo libre de enfermedades y con personas que estan al alcance de lograr la inmortalidad. Sin embargo, un extraño brote vírico se desatará dentro de las instalaciones de la escuela dando origen a una misteriosa enfermedad que convertirá a sus moradores y visitantes en monstruos sin alma y con un hambre insaciable por la carne humana, por lo que ahora dependerá de Twilight Sparkle, Cadance, Moon Dancer y dos nuevas aliadas escapar del Instituto Everton y descubrir la verdad detrás del incidente antes de que sea demasiado tarde. Ambientado en el Universo de Equestria Girls y basado en la Historia de Resident Evil 0.

Han transcurrido cuatro meses desde el Incidente Biológico en el Instituto Everton, la armonía y la paz parecen haber regresado a la región de las Montañas Equestria, pero los reportes de varios asesinatos, así como de desapariciones, ocurridos en las cercanías del Bosque Everfree han comenzado nuevamente a causar pánico y temor entre los habitantes de Canterlot City y Sire's Hollow. Ante estos hechos, el Departamento de Policía de Canterlot City le ha ordenado al Equipo Pegasus de la R.S.S.T. (Rescue Service and Special Tactics) investigar el Bosque Everfree para encontrar al o los responsables de estos crímenes, pero los miembros de dicho equipo terminan desapareciendo misteriosamente del radar policial, por lo que sus compañeros del Equipo Alicorn son enviados a aquel extraño sitio para acudir a su rescate y averiguar qué ha sucedido con ellos. Sin embargo, los integrantes del Equipo Alicorn son atacados por una jauría de perros salvajes que los obligan a refugiarse en el Everfree Vacation Center, un enorme centro vacacional que es propiedad de la empresa farmacéutica multinacional Pharmahorse Corporation, la cual está vinculada con el Incidente Biológico del Instituto Everton y cuyos macabros experimentos podrían convertirse en un legado maldito para el mundo. Ahora, los últimos sobrevivientes del Equipo Alicorn tendrán que buscar la manera de escapar de aquel siniestro lugar a la vez que irán develando los misterios y secretos que se ocultan dentro de las oscuras instalaciones. Ambientado en el Universo de Equestria Girls y basado en la Historia de Resident Evil.

Han transcurrido cuatro meses desde el Incidente Biológico en el Everfree Vacation Center, la armonía y la paz que caracterizaban a la región de las Montañas Equestria ha comenzado a desaparecer debido a que, en los alrededores de la ciudad de Sire's Hollow, se han reportado varios asesinatos, así como la aparición de extrañas criaturas nocturnas, las cuales mantienen en vilo a los habitantes de la ciudad que alberga la sede de Pharmahorse Corporation. Una noche, en una gasolinera de las afueras de Sire's Hollow, Comet Tail, un joven oficial de policía que se reporta en su primer día de servicio, se encuentra con una joven estudiante de Canterlot High School llamada Sunset Shimmer, quien está en búsqueda de información sobre su amiga Twilight Sparkle, otra estudiante de la misma escuela que había sido declarada muerta por las autoridades tras el Incidente Biológico del Instituto Everton. Sin embargo, ambos chicos terminan siendo atacados por varios cadáveres reanimados, lo que les obliga a escapar en una patrulla del Departamento de Policía de Sire's Hollow para dirigirse a la ciudad y buscar ayuda, pero al llegar a esta terminan por separarse, tomando cada uno un camino distinto, aunque prometiendo volver a reencontrarse para escapar de Sire's Hollow. Tanto Comet Tail como Sunset Shimmer tendrán que enfrentar a las distintas criaturas infernales que habitan la ciudad, así como también superar los obstáculos que se les presenten en el camino, todo ello con el fin de lograr sobrevivir y escapar de aquel lugar de pesadilla que presagia un terrible futuro para el mundo. Ambientado en el Universo de Equestria Girls y basado en la Historia de Resident Evil 2.