Ninjaxx ne se souvient de rien mise à part son nom et son expérience en matière de survie. Lorsqu'il se promenait à la recherche de ressources, il fait la rencontre de Nino, le parfait opposé de Ninjaxx.
Ninjaxx et Nino doivent accomplir une tâche qui pourrait leur coûter la vie : éliminer un virus du nom de Wither Storm. Nos héros sortiront ils indemnes de la mission confiée par Notch ?
3 mois ce sont écoulés depuis la rencontre entre Ninjaxx et Nino. Ils maîtrisent beaucoup plus le sujet de l'île, mais Ninjaxx sent de plus en plus une ''présence'' non loin d'eux. Ninjaxx et Nino découvriront ce que c'est, à leur risques et périls...