después de shadow moses, snake estaba cansado de seguir luchando en el campo de batalla, por lo que aprovechando que campbell había fingido su muerte y decidió irse a una ciudad lejana llamada racoon city y allí aprovechar su nueva vida, sin embargo el destino a snake le juega una mala pasada pues al cabo de unos días un brote viral invadió las calles de racoon city creando un escenario apocalíptico dejando envuelto en este caos a nuestro experimentado soldado. snake a pesar de ser el mejor soldado del mundo, jamas se a enfrentado a una situación así, por lo que deberá emplear sus mejores habilidades para sobrevivir...