Una historia alternativa a la tercera temporada de Sonic X sin Chris. Sonic y sus amigos disfrutan de sus aventuras despues de volver a casa cuando repentinamente Eggman contrataca con un ejercito recien llegado del espacio. Unas plantas humanoides llamadas seedrians que forman una alianza con el doctor por el control del mundo. Entre ellos se encuentra Cosmo quien busca la ayuda de Sonic para detener estos planes y reestaurar la paz.