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Cada persona nace con un código numérico único, que los identifica y diferencia de los demás; siendo este una marca especial. Cada número de los que conforman el código tiene un significado, y por ende determina rasgos, habilidades en las personas, las cuales pueden descubrirse llegando a constituir "dones" en ellas. La mayoría de los códigos están formados por cuatro dígitos, pero un porciento mínimo de la población posee solo una cifra: el cero. Por lo raro e importante de su código, se agrupan en una organización llamada Team Zero. No se sabe nada respecto a sus orígenes ni propósito, mas en la actualidad se encargan de controlar la vida de los demás. Los miembros del Team Zero están liderados por un agente que nadie ha visto jamás: "La mano de Dios". Su misión actual es tratar de alterar los códigos de otros e investigar las habilidades que pueden desarrollar.
Matsuo Kawabata, un estudiante de preparatoria, es raptado por un agente del Team Zero, como parte de una serie de extraños eventos ocurridos en el año 3064 en Tokyo.