L'histoire sera premièrement pas canon. Ce sera le multiverse, les temps dérouleront dans Ocarina Of Time mélangé à Majora's Mask et Skyward Sword, ce ne sera pas exactement la même histoire que les jeux. Zelda est la princesse d'Hyrule. Elle a exactement 10 ans et est très passionné par le monde extérieur. Alors que Ganondorf sera à la recherche de la jeune princesse, Zelda rencontrera un être bien différent de toutes personnes qu'elle a pu rencontrer jusqu'aujourd'hui...