¡Una poderosa maldición a despertado, marcando la llegada del circo Dead Beast! Ellos tienen un plan escalofriante para sumergir el mundo en una pesadilla interminable, pero requieren la luz de sus habitantes. Tras la desaparición de Spyro, Stealth Elf conoce aún nuevo recluta; Colmillo de Guerra, quien esta confabulado con el enemigo. ¡Un llamado desesperado para proteger el amor y sueños! Los Skylanders ahora tienen en sus manos, la esperanza de que el mundo no tenga que pasar por un infierno de pesadilla.

En un mundo mágico llamado Skylands, la oscuridad se cierne sobre los corazones de sus habitantes. Bestias desconocidas amenazan con corromper todo lo que encuentran a su paso, sembrando sueños rotos y desesperación. En este contexto aparece una valiente heroína, dispuesta a derrotar a las fuerzas del mal y restaurar la luz en el mundo. Durante su viaje a través de Skylands, la heroína se encuentra con un hombre por el que siente una fuerte atracción, pero las circunstancias que rodean su romance son confusas y complicadas. A pesar de ello, decide unirse a un grupo de héroes que luchan por liberar la academia de la oscuridad que la asola. Juntos, el grupo se enfrenta a todo tipo de peligros y desafíos, usando sus habilidades y su valor para derrotar a los enemigos y proteger el mundo de Skylands. Con el tiempo, la heroína tendrá que elegir entre su amor y su deber como guerrera, en una batalla final para salvar el mundo de la destrucción total.

Spyro es un héroe optimista y algo descuidado, después de haberse ido de la academia Skylanders, se embarcara en una aventura para salvar a sus padres, pero primero debe entrenar y hacerse más fuerte para los nuevos desafíos que le esperan. No esperaba encontrarse con un lugar lúgubre y con un nuevo enemigo al asecho. Todo empieza cuando Spyro, guiado por el espíritu del Maestro Eon, aterrizan en la isla de la Gran Arboleda; donde según el viejo hechicero, viven un grupo de dragones elementales llamados: Los Guardianes. Este quiere que valla a su templó para entrenar, pero al aterrizar en el bosque a las afueras de un pueblo con estilo gótico, conocido por los lugareños como Edith. Percibieron cosas extrañas y ver criaturas sombrías escondidas entre los árboles, mientras están ahí. Son testigos de un extraño evento, donde pueden apreciar varias notas musicales doradas, bailando al compás de un leve vals, cuando el Maestro Eon curioso; toca una sin saber que son, se empieza a sentir raro, escucha cosas y tiene alucinaciones muy vividas, hasta llega a atacar a Spyro sin quererlo. También escuchan de un misterioso teatro de marionetas, el cual va a hacer una función dentro de dos días solo para dragones, todo lo que paso indica que el culpable yace dentro de la fortaleza.