Pada tahun 2045 kalender masehi, mengalami awal dari krisis karena kemunculan monster misterius yang disebut Deus. Bagaimana awal kemunculan Deus, manusia tidak ada yang mengetahuinya. Tetapi makhluk itu sangat buas, brutal dan beringas. Mereka menghancurkan peradaban manusia dengan mudah dan memangsanya. Hanya dalam 4 minggu semenjak kemunculan Deus pertama di dunia, monster tersebut telah menyebar keseluruh dunia. Dalam hitungan 10 bulan sejak kemunculan Deus pertama, sudah tidak terhitung lagi berapa banyak Negara yang hancur. Lalu kemudian, dibentuklah sebuah Organisasi militer yang dikenal dengan nama Asgard yang bertugas membasmi Deus. Mereka mengembangkan persenjataan yang dibuat dari material tubuh Deus yang merupakan satu-satunya alat untuk melukai Deus, senjata itu diberi nama Divider. Manusia yang bertugas membasmi Deus dinamakan Hybrid.

The fan-fiction for the popular God Eater! Something has happened to the Leader (Ahiko) which has shook the team to the core. They slowly venture deeper into the incident to discover something that they wish they had left alone.

The story will show the continuation of the fate of Julius Visconti and the other members of Blood, implied to include Romeo based on some trailers. The Protagonist, the acting leader of Blood, is called in due to the sudden expansion of the Helix Tree, and is sent to investigate with the help of a new character, Livie, a Variant Scythe user who is taken on a regular basis to hunt turned God Eaters, and is strangely able to wield Julius' God Arc as well. Although no signs of Julius have been detected in the Helix Tree, Livie implies there is reason to believe he is alive. (This story may differ from the original game)