Gon, Killua, dan Alluka pergi bersama Ging ke suatu tempat untuk berlatih mendalami Nen yang mereka miliki. Ditengah perjalanan, mereka menemukan sebuah pemukiman terbengkalai yang hanya tinggal puing-puing dan bekas terbakar disana-sini. Disaat itu pula Ging menghilang meninggalkan mereka karena suatu alasan. Memaksa mereka tinggal untuk sementara di pemukiman tersebut. Tak terduga, mereka bertemu seseorang tidak dikenal disana. Seiring mereka bersama orang tersebut, mysteri demi mysteri yang menyelimuti pemukiman itu mulai terkuak. Apa sebenernya yang terjadi disana?

Gon dan Killua masuk ke Kelas E Kunugigaoka.