Sonic un erizo de otro planeta conoce a Amy Rose,una erizo de otra dimensión diferente a la suya qué se había perdido la memoria dónde ambos se tendrán qué ayudar para derrotar a un genio loco de la robótica qué los quiere atrapar

Luego de los sucesos de la primera película Sonic y Amy se embarcan en una Nueva aventura para detener a Robotnik a su nuevo aliado y antigua conocida de Amy mientras que ellos reciben la visita de nuevos y viejos amigos

Luego de lo sucedido en su última batalla contra Robotnik Sonamy y el resto de la pandilla

Luego de una pelea contra un Lobo Sonic quéda herido pero ésto provoca qué Sonic cambié... justamente en la noche de Helloween

El comandante Walter de G.U.N pide la ayuda de Sonic y Amy Rose junto al restó de sus amigos para capturar al proyecto Shadow una criatura sumamente poderosa mientras qué es acompañado por Ivy Rouge una clon de Amy Rose creada por el Eggman de su dimensión para destruir a Sonic y sin muchas opciones para detener a ambos Sonic y Amy tendrán qué recurrir a un viejo "Amigo" para detener a ambos erizos oscuros