Después de una intensa batalla que culminó con la derrota de Megatron, los Autobots, junto con sus aliados humanos y el ejército, han formado una poderosa alianza llamada NEST que se dedica a proteger la Tierra de cualquier amenaza que ponga en peligro su existencia, sin embargo, la paz es efímera una nueva y oscura amenaza surge del pasado The fallen, un antiguo enemigo decidido a vengarse y recuperar su lugar como el líder del mal con su ejército de Decepticons, The fallen busca destruir a los Autobots y sembrar el caos en el planeta.

Ha pasado un año desde la partida de Optimus Prime, y el mundo ha cambiado. Los Autobots, junto con los valientes Caballeros legendarios y la familia Loud, deben unirse para enfrentar una amenaza inminente: un ser poderoso que ha estado dormido durante milenios está a punto de despertar.

Han pasado dos años desde que los Autobots y los Louds unieron fuerzas para derrotar a Quintessa, disfrutando de un período de paz y armonía en la tierra, sin embargo, esta calma se ve interrumpida por el regreso del temible The fallen, quien ha estado planeando su venganza desde las sombras con un ejército de antiguos Decepticons a su disposición, The fallen busca recuperar su poder y destruir a los Autobots de una vez por todas.

Los Autobots, se alían con los Maximals, una facción de guerreros provenientes de una línea temporal diferente, quienes adoptan formas animales para fusionarse con la naturaleza los Maximals, liderados por Optimus Primal, representan un tipo de sabiduría y conocimiento ancestral. A pesar de sus diferencias, estas facciones comprenden que su única esperanza para detener a Unicron y he fallen antes que destruya tanto el universo como el tiempo.

Cinco años después de la devastadora Batalla de Chicago, los Autobots y los Louds han logrado restablecer una frágil paz en la tierra, sin embargo, esta calma es interrumpida por la llegada de Lockdown, un temible cazarrecompensas que ha sido contratado para cazar a los Autobots y a Optimus Prime ahora Lincoln y los Autobots deben unir fuerzas para derrotar a este mercenario que busca extinguir toda vida en la tierra.