No limiar da Galáxia Nexus, onde civilizações inteiras se ergueram e caíram em busca de um antigo poder chamado "NEX", a procura por este poder transformou os duelos em algo mais, eles se tornaram uma herança e uma linguagem feita com a união entre monstros, magias e armadilhas. Mesmo sendo uma criação do Planeta Terra, civilizações vigiavam a humanidade a anos-luz de distância e perceberam que os modos de jogo do famoso "Monstros de Duelo" eram muito limitados e precisavam de uma atualização, tanto nas regras quanto nas cartas. Em um lugar distante da Galáxia Nexus, seres tecnologicamente mais avançados transformaram o jogo de cartas Monstros de Duelo em um estilo de vida e até mesmo criaram culturas próprias, mas parte deles optaram por usar o jogo como um meio de guerrear contra povos que não sabiam da existência dele e foram obrigados a aprender sobre ele para defenderem. Mas, em um determinado momento, toda a galáxia descobre que um poder esquecido despertou: a Invocação-Uníssona, que unificava os três principais tipos de cartas em uma nova entidade. Neste contexto, uma jovem, Lyra Kairos, vive como uma duelista que foi exilada do império interplanetário Phantrax, porém, ele acaba por descobrir um baralho ancestral em meio às ruínas do Planeta Caelora. Ao fundir monstros, magias e armadilhas pela primeira vez em anos, ela invoca o Guardião Estelar de Caelora, e assim marca o renascer da Invocação-Uníssona e se torna alvo de uma caçada interplanetária. Agora, Lyra viaja de planeta em planeta, enfrentando duelistas fortes com baralhos poderosos que foram manipulados pelo Império, assim como caçadores psíquicos e seres que tem o desejo de controlar todos os cantos da galáxia de Nexus para moldar o universo à sua vontade; o que começa como sobrevivência se transforma em algo maior, uma sinfonia de duelos onde Lyra precisará unir corações e baralhos a um único destino: salvar a galáxia de uma guerra universal.

Um fuzileiro naval americano, treinado para combate extremo, lidera uma equipe em uma missão para destruir grupos de guerrilheiros nas regiões geladas no sul do Brasil. Entretanto, o grupo recebeu a ordem para matar os reféns presos. Se recusando a isso, o fuzileiro ataca seu superior e é preso. E como sua punição, a equipe é desfeita e o fuzileiro é mandado para Phobos, uma das luas de Marte. Mas, ele descobriria que algo ainda pior e infernal aconteceria quando chegasse lá.

Seguindo os acontecimentos de "Juntos Para Sempre", Naruto tornou-se o novo Hokage de Konoha e agora era responsável pela administração e pela manutenção de sua vila. Porém, a notícia que se espalhou pelo mundo fora recebida até mesmo pelos membros da Akatsuki e por Orochimaru. Por este motivo, ambos se viram forçados a modificar os seus planos de dominação mundial e conseguirem capturar os dois últimos Jinchuurikis que restavam: Naruto e Killer Bee. Sendo assim, toda a Akatsuki foi espalhada pelos quatro cantos do mundo e estavam prontos para realizar um ataque de proporções gigantescas contra todo o mundo ninja. Este não é apenas o fim das nações ou das vilas. Este é fim dos tempos!

Após a dura batalha contra Pain, Naruto voltou para casa como herói. Sendo reconhecido por todos os que antes o viam como um monstro. Porém, ele ainda não acreditava que havia perdido o seu mestre, Jiraiya. As glórias se acumularam em volta dele, mas ele não festejou ao saber que havia perdido a única pessoa que ainda fazia parte da sua família, então ele se isola de tudo e de todos em sua casa, caindo em uma profunda depressão. Só que, ele não contava que alguma coisa viria para mudar sua vida completamente.