[Akatsuki in Boruto Universe] Akatsuki adalah organisasi yang berisikan ninja-ninja buronan rank-S yang mengumpulkan para Bijuu ke dalam sebuah Patung. Tapi saat mereka melakukan jurus segel, Tobi tidak sengaja mengucap sebuah jutsu lain, dan menyebabkan mereka semua terlempar ke masa depan, zaman pemerintahan Nanadaime, bertemu Himawari yang menjadi Jinchuuriki dan angkatan Boruto yang menjadi genin. Ini adalah kisah Akatsuki yang menginap di Desa Konoha yang kini menjadi modern. [Ada hubungannya dengan cerita Harmonious]