Midnight Rain narra la historia de Nyssa Jones, quien después de perder a su madre y de la desaparición posterior de su padre decide convertirse en una de los Siete Guerreros del Mar, junto a su mejor amigo/ casi hermano Monkey D. Luffy se embarcan en una aventura para encontrar el mayor tesoro y mas buscado por piratas de todo el mundo, el One Piece. En el camino conocen a gente, amigos, enemigos, una nueva tripulación y ¿romance?