Después de conseguir el retromutágeno para Splinter, logrando el objetivo en hacerlo humano a él y los infectados. El maestro y padre de las tortugas sale de viaje, Leonardo como el hermano mayor queda a cargo. En una patrulla normal, pelean contra Baxter Stockman y un arma sumante peligrosa que los rejuvenece hasta tener la edad de niños.

La salamandriana guerrera en su viaje por el espacio, su nave fue impactada por otra, interrumpiendo su misión de salvar su planeta, la única alternativa que le queda es pedir refuerzos a los Triceratons, el Capitán Mozar le juró ayudarla a cambio de capturarle unos enemigos, las tortugas ninja. NOTAS: ◇Donatello sin percatarse consigue conquistar el corazón de la lagartija, MonaLisa, por sus inventos e ideas innovadoras. ◇Abril sufrirá fragmentos en su mente sobre su especie alien, podrá ser interprete de lenguaje junto a Michelangelo que es el nuevo líder del equipo. ◇Leonardo acompañará a Fugitoid en todo, su vínculo será de padre e hijo.

Nunca existió Karai, las tortugas ninja disfrutan de la compañia de su hermana mayor, la hija biológica de Hamato Yoshi. El clan pie busca venganza, Destructor planea adueñarse de la felicidad de su enemigo. Notas: ■ ships fanons ■Pequeños cambios bruscos en la narrativa canon, haré mención de ciertos eventos dados en la serie.

El loco Jones nunca se imaginó estar metido en las alcantarillas y mucho menos con las tortugas ninjas, pero lo agradece profundamente luego de ser rechazado por Abril, se dá cuenta que se enamoró de su rival amoroso. A medida que compartía tiempo con el nerd. NOTA: ■ Posiblemente haya varios ships fanon y un poco de Leorai. ■ Y Michelangelo nunca conoció a Renet/Shinigami. ■ Irma es humana y buena amiga.

Abril juró tener una amiga, Irma era su hermana de secretos y risas dentro del colegio, pero notó un comportamiento raro cuando mencionaba que amaba las tortugas y las cosas ninjas. NOTAS: ■ Casey tiene de hermana a Chloe, la niña que toma el té con las tortugas. ■ Abril muestra su lado Kraang. ■ Ship fanon

Abril pone a prueba sus conocimientos de psicología dados por su padre y manda a terapia a sus amigos, las tortugas. ¿Cuál será el paciente menos adaptado a sus sesiones de terapia?

Leonardo y sus hermanos trabajaran con la ayuda de una misteriosa Kunoichi, que revela ser una bruja, Shinigami. Juntos planean rescatar a Karai e impedir la doble invasión. NOTA: ■ Shini no es lesbiana (únicamente es AMIGA de Karai). ■ Ship fanon Leonardo x Shinigami (Leogami). Principalmente; hay más ship fanon.

El nerd es poseido, convirtiéndose en un fiel sirviente del mal. Donatello se une al Clan Pie, elabora un plan maestro con los secuaces de Destructor y ganan la aprobación de completarlo. Uno a uno cae en las trampas, Leonardo esta destrozado y decepcionado de su liderazgo. Los mutanimales llegan al rescate pero es demasiado tarde. Raphael y Michelangelo, los únicos hermanos, junto a sus amigos humanos, Casey Jones y Abril, han perdido identidad. Ahora son experimentos de la tortuga traidora. Nota extra: Irma es humana y buena amiga.

La influencia de Abril en el grupo masculino encadenó más de un enamoramiento, su compañia alegraba el ambiente tras pelear contra ninjas, ella despertaba el lado más bonito de cada integrante y Raphael quiere negarlo. ¿Qué pasaría si Donnie fuera rechazado? ¿Podría vivir con el corazón roto? Basada en la temporada 1 (más o menos) Nota extra: Irma es humana y buena amiga.