Em um mundo onde a humanidade carrega traços e instintos animais, a sociedade é dividida por dinâmicas de Alfas, Betas e Ômegas. Isagi Yoichi, um Ômega com cheiro de camomila e a natureza dócil de um cachorro doméstico, sempre viveu em um ninho seguro, protegido por seus pais. Mas a tranquilidade de sua vida é abalada quando ele é aceito na prestigiada Blue Lock High, uma escola de elite exclusiva para garotos. O que ele encontra lá é uma selva de concreto, uma fortaleza de feromônios e Alfas dominantes. A Blue Lock é um ambiente de alta competitividade, onde os instintos mais selvagens estão à flor da pele. Para sobreviver, Isagi deve aprender a navegar por um novo mundo onde seu cheiro suave pode ser visto como uma fraqueza e um convite. No meio do caos, ele encontra Bachira Meguru, um Ômega guaxinim com cheiro de mel e uma energia contagiante. Juntos, eles formam uma aliança inesperada, usando suas naturezas de Ômega não para se submeter, mas para desafiar as regras do jogo. Enquanto a relação de Isagi com Bachira floresce, ele também cruza o caminho de Kaiser, um Alfa puro de tigre branco com cheiro de rosas. A dominância de Kaiser é avassaladora, e a atração entre eles é tão intensa quanto perigosa. Isagi se vê em um dilema: ele pode sucumbir aos seus instintos e se render aos perigos de um vínculo, ou resistir e tentar manter sua identidade em um mundo que parece determinado a marcá-lo. Essa é uma história de sobrevivência, desejo e autodescoberta. Uma jornada em que a pureza da camomila de Isagi confronta o poder das rosas de Kaiser, onde a amizade inesperada é um escudo e a marca pode ser tanto a salvação quanto a perdição.

Isagi é um estudante bastante conhecido por sua inteligência na escola, não é atoa que veio para a Alemanha cursar educação física em uma das melhores faculdades do mundo. Uma delas está localizada na Alemanha, a Blue Lock. Isagi gosta bastante de livros e aprender coisas novas, ama se aventurar, mas até certo ponto, seu físico não é um dos melhores ainda. Kaiser, um jovem adorado por todos por sua beleza e charme. Kaiser é do time de futebol da faculdade, o Bastard München, o nome se deu origem ao um time de verdade da Alemanha. Kaiser é famoso entre as garotas e até mesmo garotos, ele tem um humor sugestivo, ego alto e por sinal é bem irritante, porém, apenas com Yoichi. Um certo dia, Kaiser estava em conflito consigo mesmo, ele precisava forjar uma mentira em cima da hora e Isagi era sua única opção. Será que Isagi irá ao menos considerar as "súplicas" de Kaiser? seu inimigo?