A pequena Ofélia, de apenas 13 anos, vive na Espanha e já enfrenta os perigos da guerra. Uma amante dos livros e de lugares extraordinários. Ela sente sua vida mudar completamente quando a mãe, Carmen Cardoso, casa-se com o capitão Ernesto Vidal. Um homem frio e distante que desperta o medo na pequena. Para sua extrema tristeza, ela e a mãe estão de mudança para a casa desse homem. Sua mãe carrega no ventre o filho dele, meio-irmão de Ofélia. Neste lugar isolado, margeado por um labirinto, nossa protagonista irá ao encontro do mágico e fantástico. É lá que ela conhecerá um antigo Fauno e todas as outras criaturas que fazem parte do seu mundo. "Sua mãe dizia que os contos de fadas não tinham nenhuma relação com o mundo real, mas Ofélia sabia que tinham. Os contos haviam lhe ensinado tudo sobre o mundo." Será o Fauno que lhe contará sobre a lenda da princesa perdida. Ele fará com que Ofélia enfrente desafios para que eles descubram a verdade sobre sua vida. A partir daí, real e imaginário se mesclam entregando algo único. Em meio a guerra e a tristeza, essa jovem criança buscará refúgio em um mundo mágico.