La team Sonic revient de leurs vacances d'été après un long séjour à Green Hill. Shadow de son côté s'apprête à franchir une nouvelle étape, toujours hanté par son passé et ayant la pression venant de beaucoup de gens. De nouveau couples se créent, le couple d'Amy et Sonic semble être sur le point de se fissurer et Shadow commence à ressentir des sentiments qu'il n'arrive pas à comprendre. Que va-t'il advenir de ces personnages?