Nightmare Butterfly adalah organisasi Interpol kelas S yang bertugas untuk membunuh, mereka memiliki jaringan dan kekuasaan tak terbatas. Para anggotanya sangat kuat, melebihi 1000 tentara elit sekali pun, dan anggota NB juga memiliki kekuatan supernatural. Kisah dimulai dari seorang gadis anggota NB bernama Yukishiro Hikaru.

Cerita mengenai klub detektif dalam menangani kasus-kasus kejahatan di lingkungan kampus

Mikha, mahasiswa yang suka teka-teki. Nami kitagawa, gadis jutawan yang suka berpetualang. Jun kitagawa, hacker jenius yang mengetahui berbagai rahasia dunia. Ruben, pria keturunan timur tengah yang menguasai 13 bahasa. Mereka bersama menyelidiki sebuah konspirasi dunia... Yang ditutupi oleh pemerintah... Yang ditutupi oleh organisasi berbahaya... Bahkan yang ditutupi oleh tokoh agama... Ini tentang seorang pria... Pria itu bernama... Yohanes... Siapa dia sebenarnya???