La storia è ambientata alla One Piece High School un prestigioso collegge della città di Marineford, dove gli studenti arrivano da tutte le parti del paese, gestito dal preside Sengoku andato alla carica dopo Gol D. Roger, l'istituto ospita i ragazzi anche alla notte grazie ai dormitori, ma gli studenti non sono proprio l'immagine della tranquillità e della disciplina. Per questo gli sei studenti del Comitato disciplinare avranno il loro bel da fare. Amori, intrighi ,fidanzamenti non del tutto leciti, punizioni, sentimenti e passioni coinvolgeranno i Mugiwara e non solo in questa scuola fuori dal comune.