En esta versión de TMNT los chicos terminan en manos de los Kraangs antes que Hamato Yoshi. Pero por un error los hermanos son separados desde que son bebés ya mutados a distintos lugares del universo. Siendo criados por enemigos conocidos como los Tricerators o los Salamandrianos, cambiando el curso de sus historias. Pero el destino, el odio y rencor entre razas alienígenas hará que sus caminos se crucen de nuevo en la tierra. Todos bajo un mismo enemigo, los Kraangs, quienes comenzaron todo esto y quienes se quedaron con uno de los hermanos para completar su serie de experimentos de armas biológicas.

En la isla de los perdidos habitan los Desendientes de los peores villanos del mundo mientra que en Auradon habitan los Desendientes de los reyes y reinas que pasaría si un día ellos se encontrarán para cambiar su destino de villanos nuevas aventuras nuevos amores

Era un dia normal en la vida de Leonardo, una noche el sale a tomar aire... Todo cambia cuando ve a Karai acercándose a el con un pequeño bulto en brazos. Ella se hacerca con una cara triste le entrega el pequeño bulto a Leo y se aleja corriendo lo más rapido posible, ese queda en estado de shock hasta que siente movimiento del bulto... Al descubrir la manta ve a una pequeña tortuguita aparentemente no pasaba del mes de nacido, tenia ojos color añil como el y piel clara... ¡Era su hijo! ¿Que haría? ¿Que dirian de el? <<NO AL PLAGIO>> Tengan algo de imaginación