La tierra de Gensokyo se ha enfrentado a muchos incidentes en el pasado, sin embargo una cadena de eventos imprevistos, bajo condiciones anormales han traído a un joven soldado a esta tierra de ilusión, sin embargo este humano es diferente al resto. El joven humano deberá luchar para sobrevivir en este ambiente hostil, en su viaje conocerá a dioses y demonios, monstruos y entidades que desafían toda lógica humana, que buscaran ayudarlo o matarlo. Los engranes del destino comenzaran a girar y acarrearan incidentes y eventos que podrían desencadenar la destrucción de la propia Gensokyo.