Skyler is een normaal meisje, totdat ze een mysterieuze brief krijgt. Daarin staat dat ze de enige persoon is die de wereld kan redden. Eerst lijkt het erop dat ze de wereld moet redden van de Shadows, de slechte variant van de Guardians. Maar als snel blijkt dat er veel meer aan de hand is. Kan Skyler de wereld redde...
Het is zover, Anna wordt tien en mag eindelijk beginnen aan haar Pokémon reis. Samen met haar team probeert ze genoeg lintjes te krijgen waardoor ze uiteindelijk mee kan doen aan het grand festival, die ze natuurlijk graag wil winnen. De reis verloopt alleen anders dan ze verwacht had. Ze komt tegenover allerlei obsta...
Er heerst al jaren een oorlog tussen de mensen en de elven. Bijna niemand weet hiervan, het wordt verzwegen in beide werelden. De twee rassen weten van elkaar niet eens dat ze bestaan. Dat is totdat de elf Coby per ongeluk in de mensenwereld terechtkomt. Ze ontmoet Anna, die vreemde krachten heeft waar ze zelf niks va...
Als Coby 10 jaar wordt, begint ze meteen met haar avontuur als trainer. Samen met haar partner Charmander reist ze heel Kanto door, om alle badges te verzamelen en uiteindelijk de league te verslaan. Maar op haar weg wordt ze door veel dingen gehinderd. En dan is er ook nog de criminele groep Team Rocket, die Pokémon...
Nadat Coby klaar was met haar reis door Johto, besluit ze om naar Sinnoh te gaan. Op het schip komt ze Anna tegen, een Pokémon Coördinator uit Hoenn en haar Plusle. Ze besluiten om hun reis samen te beginnen, maar die gaat heel anders dan dat ze eigenlijk hadden verwacht...