Una ola de materia oscura golpeó el planeta, pero reaccionó con la energía oscura y la materia ordinaria resultando en personas con habilidades increíbles con el uso y control de la energía oscura dentro y fuera de ellos recibiendo el nombre de Nix. Nintai Shio, un joven adolescente fue expuesto a la ola, pero no recuerda su pasado; se encuentra con Amai Ikari, una chica misteriosa que lo acompaña en su aventura por desarrollar su Nix sin saber que ella vino para cuidar de él y evitar que otros del espacio exterior lo encuentren, porque ven a Nintai como una amenaza.