Dopo la battaglia contro Tartaros la Gilda di Fairy Tail ha cessato di esistere. Dopo tre anni, Natsu fa finalmente ritorno a Magnolia venendo così a sapere dello scioglimento della Gilda verificatosi subito dopo la sua partenza. La maggior parte dei suoi compagni si è rifatto una vita ma del membro che più gli sta a cuore non vi è nessuna traccia. Lucy sembra svanita nel nulla e nessuno sa che fine possa aver fatto. Finché un giorno, strane voci giungono all'orecchio del Dragon Slayer. Voci che circolano tra le Gilde Oscure riguardanti un misterioso mercenario noto come l'"Incappucciato", un mago che sembra in qualche modo essere associato a Lucy. Ma in cosa consisteranno queste voci? Cosa è successo alla giovane maga durante questi tre anni?

Mi ha trovata. Mi ha aiutata. Mi ha salvata. Mi ha persa. Mi ha ritrovata.