L'académie Ikamura est la plus influente du Japon. Le narrateur Subaru est élève à cette prestigieuse école constitué de 15 élèves. Tout allait bien jusqu'au jour où un meurtre a lieu au sein de l'établissement.

Il était une fois une fille. Une fille qui semble être comme les autres mais qui en secret aide les esprits à allez au cieux. Il s'agit d'une Shinigami. Pour cette jeune fille sa vie était contrôlé. Le jour elle allait au lycée et la nuit elle s'occupait de ces esprits. Jusqu'au jour où un garçon la voie s'occuper d'un esprit...