Pit aparece en una zona lejana de su hogar luego de tener un enfrentamiento contra una nueva amenaza contra skyworld donde ... una nueva forma..se apoderara de el. Se reencontrara con Link,un antiguo luchador del evento super smash bros donde se concieron y se hicieron amigos pero no lo reconocera con su nueva apariencia. Esta apariencia y su verdadero yo harab que el pobre hyliano este confundido . Pero uniran fuerzas para vencer a un mal que amenaza con atacar hyrule y skyworld..aunque..algunos de sus aliados..no esten..indispuestos...