Sophie Lee jest zwykłą dziewczyną. Pewnej nocy zobaczyła coś, czego nigdy nie miała zobaczyć. Zostaje porwana i przetrzymywana przez dwunastu braci. Przez cały jej pobyt z najmłodszym z nich dzieję się coś dziwnego. Czy Sophie zdoła przed nim uciec?

Upłynęło dużo czasu od momentu w którym Super komputer został wyłączony. Ale pewnego dnia wszystko się zmieni... Yumi, Aelita, Odd, Jeremy, William i Urlich będą musieli stawić czoła wielu wyzwaniom które czyhają na nich w świecie Lyoko. Czy uda im się pokonać XANĘ i Tyron'a raz na zawsze? Czy otrzymają pomoc od innych osób?