Muchos años después de los eventos que toman lugar en la serie original, Equestria pasa por una gran época de paz sin precedentes. No obstante, una noche, la retirada princesa Twilight Sparkle recibe un llamado en su cutie mark por primera vez en más de un milenio. Un poco extrañada va hacia la sala principal de su antiguo Castillo de la Amistad enseguida, solo para descubrir que la localización de su llamado no está en ningún lugar del Cutie Map.

Set in the My Little Pony: Friendship is Magic universe, years after the pre-timeskip series finale, an ambitious pegasus intends to revamp the way society works in order to be stronger and safer from future villains from appearing. He cares not for ethics though, it's all a means to an end...