Link et Zelda, après avoir vaincu Ganon, veulent confier les créatures divines aux descendants de Mipha, Daruk, Revali et Urbosa, et leur enseigner tout ce qu'ils savent sur elles. Les esprits des prodiges, vont se consacrer à l'apprentissage de leur descendants, pour qu'ils sachent convenablement manier celle-ci. Mais n'oublions pas que ce n'est qu'un jeu...