Fala brutalnych morderstw zalewa Japonię, a każda ofiara zostaje naznaczona czarną lilią. Ludzie boją się wychodzić z domów, bo nawet zawodowi bohaterowie sobie nie radzą. Wtedy na scenę wkracza Eraser Head, dotąd nieznany, jednak od razu zabłysnął, znajdując trop prowadzący do mordercy. Kobieta o tajemniczej przeszłości znów pojawia się w życiu Aizawy Shouty, a mężczyzna próbuje rozwiązać jedną z największych zagadek swojego życia - samotnej dziewczynki, którą poznał w dzieciństwie.