Evan ha ganado la Liga Pokémon Juvenil de Kanto, y se va a Johto con el objetivo de ganar la Liga Pokémon de esta región y encontrar a Sara, pero los padres de ésta y el Team Shadow están de por medio. Lo logrará?

Esta historia narra las aventuras de Evan y sus amigos Sara, Brix, Génesis y Rex en la Región de Kanto, combatiendo el mal y venciendo entrenadores para llegar a la cima