Sameen Shaw, une femme pas comme les autres, jusqu'à ce qu'elle rencontre Samantha ''Root'' Groves cette femme va l'a faire changer enfin presque...

"on vous surveille. Le Gouvernement possède un dispositif secret, Une Machine.Elle vous espionne jour et nuit, sans relâche. Je le sais parce que c'est moi qui l'ai créée.Je l'avais conçue pour pour prevenir des actes de terrorisme, mais la Machine vois tout, tout les crimes impliquants des citoyens ordinaires, tel que vous. Des citoyens que le gouvernement considère sans important, mais pas nous.Traqués par les autorités, nous travaillons dans l'ombre, jamais vous nous trouverez. Mais si votre numero apparaît, nous, nous vous trouverons."

"J'ai appris que tout le monde est seul face à la mort... Mais si vous avez compté pour quelqu'un, si vous avez aidé, ou aimé quelqu'un, s'il n'y a ne serait ce qu'une seule personne qui se souvienne de vous... Alors peut-être que vous ne mourrez pas tout à fait... Et peut-être que ce n'est pas du tout la fin". Plus d'un an s'est écoulé depuis la fin brutale de Samaritain, geôlier de l'humanité. Abbatu par une poignée d'âmes braves et insouciantes, sacrifiées dans cette terrible bataille opposant David contre Goliath. Le monde, lui s'est remis à tourner, ignorant. Les quelques survivants de cette guerre de l'ombre profitent désormais, quant à eux de la lumière recouvrée, tentant inlassablement de trouver un sens à cette nouvelle existence qui s'offre à eux. Pour combien de temps encore?

Nous suivons Eliot Warner, jeune étudiant en seconde au lycée de Feather Spears, ayant une vie normale jusqu'au jour où plus rien ne va ; la mort de sa professeure. Aux côtés de Katsura Arateo, Aki Mono Norîka-Suki et Casey Armondès, il tentera de résoudre cette affaire mais malheureusement... cette tueuse va l'emmener dans un "endroit" que personne n'aurait imaginé. Disons que.. n'importe quel scientifique y donnerait sa vie pour y parvenir.