Après des matchs remplis d'efforts et d'émotions, la société Éris a été vaincue. À présent, un nouveau tournoi FFI, sans drogue ni corruptions, est organisé, 3 mois après le premier. Mais comment être sûrs que tout se passera bien, avec la fondation Orion No Kokuin toujours dans la course ? Ses membres n'ont pas lâché l'affaire, loin de là. Au contraire, ils sont plus déterminés que jamais à accomplir leurs sombres desseins. À l'intérieur même de l'organisation, Froy Girikanan mène sa propre bataille, qui pourrait l'amener à découvrir des secrets qui n'auraient jamais dû l'être... Rien n'est fini. Les événements s'enchaînent, et le temps passe de manière tellement aussi naturelle que d'habitude. Est-ce que tout prendra fin un jour ? Ont-ils réellement une chance de rétablir la paix et la vérité dans le monde du football ? Les Japonais se donnent la mission d'au moins essayer. Et cette fois, ils n'ont pas le droit à l'erreur.

Grâce à leurs efforts, les joueurs d'Inazuma Japan accèdent enfin aux faces finales du FFI. Mais plusieurs événements se succèdent, tous plus étranges et suspects les uns que les autres. Il semblerait que quelque chose d'encore plus gros et dangereux qu'Orion se cache derrière le tournoi... Ils pensaient participer à un simple tournoi mondial. Mais ils découvrent que l'enjeu est en réalité beaucoup plus important. Orion n'était rien comparé à la véritable menace, qui est prête à tout pour arriver à ses fins. Inazuma Japan n'a pas le droit de perdre lors de ce tournoi. Parce que ce n'est pas que le titre de champions du monde qui est en jeu... Mais la sécurité du monde entier.