Una extraña luz cayo en las montañas de la region Kanto y el misterio que la rodea llevará a 2 jovenes en compañía de otros entrenadores en averiguar tal misterio. Iniciando una carrera contra el tiempo contra una malvada organización, una extraña fuerza sobrenatural y una vieja rivalidad. Tal viaje los llevará a explorar y conocer lugares y zonas más allá de la región de Kanto así como encontrarse a viejos amigos y nuevos amigos.