No ano de 2015, em um mundo que acabara de ser reconstruído após o evento conhecido como "segundo impacto" cujo devastou a humanidade, uma corporação denominada "NERV" faz seus esforços contra as ameaças provenientes de tal acontecimento. Os pilotos das unidades Evangelions se veem perante a novos inimigos e novas ameaças que os fazem perceber quem são os reais vilões. E mesmo que tenham de entregar suas vidas, eles devem lutar para que a humanidade possa ver o amanhã.