Naruto es el Héroe de la 4 Gran Guerrera Ninja, trayendo la paz a en las 5 Grandes Naciones Shinobis, siendo el nuevo Jinchuriki de los 9 Bijuus también salvador de la Tierra al detener el responsable de la Luna al intentar destruir a la Tierra. Cómo tambien en iniciar su relación con su amiga Hinata Hyuga, ahora mismo en una misión de regreso a la aldea fue enviado a otra realidad, por un desconocido.

Un nuevo año escolar en el colegio de Howards de Magia y Hechicería, nuestro héroe Naruto Uzumaki con ayuda de Harry Potter tratarán de averiguar los extraños sucesos que pasan en el Colegio. Debido a qué el Heredero de Salazar Slytherin ah abierto la Cámara de los Secretos.

El tercer año el colegio de Howards está siendo amenazado por el prisionero de Azkaban Siruis Black ah escapado de la prisión de máxima seguridad. Cómo aran Naruto y Harry en lograr encontrar a este hombre que amenaza la vida de Harry al saber que es un fiel seguidor de Lord Voldemort, que intenta vengarse de Harry.

Luego de los eventos de la aventura anterior, nuestro ninjas rubio Hiperactivo, estara en un gran problema en que tendría que demostrar que es capaz en un peligro torneo magico.

Luego de qué Lord Voldemort volviera a la vida, Naruto se lleva a Harry a entrar, las cosas de en el Mundo Mágico se volverán totalmente diferentes. Ya que el Ministerio de Magia está en un conflicto por el asunto, que involucrará la vida de los estudiantes del colegio de Howards de Magia y Hechicería. Sin embargo no todo está mal ya que está nueva aventura pasarán muchas cosas qué aran sorpender a nuestro Rubio ninja favorito.

Acompaña a Naruto en su sexto año en el colegio de Howards de Magia y no, en compañía de Harry y sus amigos en resolver el misterio de un personaje muy peculiar.

La última aventura de Naruto al lado de Harry Potter en donde deberán de acabar con la guerra que se avecina.