A történet a már ismert Spiderwick krónikák világában játszódik, sok sok évvel a filmbeli események után. Jared Grace már megöregedett, már csak a ház gondnokaként jár vissza egykori otthonába, ügyelve rá, hogy senki ne találhassa meg a titkos szobát és a könyvet. Egy nap azonban új lakók költöznek a házba, Jared minden igyekezete ellenére egy kíváncsi testvérpár kezdi felfedni a ház rejtelmeit...