2140, après les catastrophes qui ont détruit la Terre, l'humanité s'est exilée dans l'espace sur des îles artificielles. Alice vivait une vie paisible sur l'île New York, entourée de sa mère et de ses amis jusqu'au jour où, par le fruit du hasard, elle se retrouve avec une androïde amnésique sur les bras. Comme si ça ne suffisait pas, des hommes d'une organisation mystérieuse se mettent à sa poursuite pour s'emparer de l'androïde. Alice ne peut pas se permettre de laisser l'androïde tomber entre leurs mains, au risque de perdre la seule personne capable de l'aider à savoir ce qui est arrivé à son père, disparu depuis des années. Accompagnée d'un inspecteur terriblement casse-pieds, Alice n'a d'autre choix que de trouver un moyen de faire revenir les souvenirs de l'androïde tout en évitant les griffes de ses poursuivants. Leurs recherches les mèneront dans des lieux au combien dangereux et les pousseront à remettre en question l'ensemble de leur vie sur l'archipel Terra-2.