Esta historia comienza después del ataque de Kiuby a la aldea Anko siendo una bebé queda huérfana igual que Naruto tras la muerte de sus padres y es encontrada por Sarutobi después de encontrar a Naruto en manos de Minato y Kushina muertos tras sellar el Kiuby en Naruto los dos fueron cuidado llevado por Sarutobi al orfanato. Y este Kabuto es alumno de Orochimaru y se queda en Konoha para espiar la aldea.