Roku2203
Luego de combatir contra Yubel, Yudai regresa a la academia de duelos. Durante un tiempo la tranquilidad gobernó los territorios de la Academia, dos semanas pacificas transcurrieron hasta que por fin la academia abrió sus puertas para que nuevos duelistas intentaran ingresar a la escuela. Sin embargo, la sombra acechaba en silencio a sus presas esperando el momento indicado para revelarse y causar el despertar de un antiguo y poderoso poder.
Yudai, Syrus, Alexis, Chazz y Atticus asisten a los combates de los nuevos aspirantes llevándose varias sorpresas al observar la habilidad y estilo de combate de los nuevos estudiantes. Muchas aventuras esperan, peligros incomparables y duelos épicos.
*ACLARACIÓN*
- La historia está situada luego de los acontecimientos de Yubel dentro de la serie original, en esta historia Yudai y sus compañeros aún no se gradúan puesto que les hace falta un año escolar.
- Yubel acompañará siempre a Yudai y será tratado como una entidad similar al Faraón, sin embargo, no participará en todos los duelos que se librarán, solo en algunos... Será más bien una consejera de Yudai y "As bajo la manga" del personaje antes mencionado.
- Habrán trampas locas debido a que eso ayuda a que la trama avance mas fluidamente.